Від початку 1980-х років у творчій біографії Хабибулліна намітився поворот до історичної тематики. Він поставив за мету художньо відобразити найважливіші етапи історичного розвитку татарського народу в минулому. Першим таким твором став роман «Кубрат-хан» (1985), присвячений засновнику першої тюрко-болгарської держави на території Приазов’я та Західного Північного Кавказу в VII столітті. У другій половині 1980-х і в 1990-х роках були написані романи «Посол — особа недоторкана», «Чортове городище», «Сююмбике-ханбике й Іван Грозний», «Онук хана Хансуар», «Божий подарунок», «Батый-хан і Ляйля», «Айбиби», які охоплюють історичні події часів Волзької Булгарії та Казанського ханства, а також роман у двох частинах «Атилла», присвячений легендарному полководцю гунів, що в VI столітті н.е. завоював могутню Римську імперію. Історичні романи Мусагіта Хабибулліна вирізняються гострим, захопливим сюжетом і достовірністю зображуваних картин життя різних народів далекого минулого.