«Хмарний атлас» містить шість історій, головні герої яких мають щось спільне: родима пляма у формі комети. В усьому іншому — у кожного свій шлях, свої шанси померти чи вижити. Кожен наступний носій родової мітки знає про попередника, наприклад, читаючи щоденник або дивлячись фільм. Ланцюг випадковостей, що пов’язує життя людей, де є місце зрадам і вбивствам, а також любові, вірності, подвигу. Зрештою — роздуми автора про добро і зло, майбутнє людства, значення людського життя.